多肽组学（peptidome），即通过多种方法系统、全面、定性及定量的研究从特定时间和位置获取的生物样本中的内源性肽段的一门学科。多肽组学在组学研究领域具有重要作用，是对蛋白质组学的补充，是蛋白质组学和代谢组学之间的桥梁。通过多肽组学可以更好地理解蛋白酶的功能和消化过程，寻找具有生物学意义的多肽标志物，筛选具有生物学活性的潜在治疗药物。