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【医药加】非编码RNA数据挖掘分析与课题设计班
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更新 2025-08-12 12:07
 
详细信息
【医药加】非编码RNA数据挖掘分析与课题设计学习班
本课程北上广均会开办,请联系主办单位咨询最近课程安排
主办方:医药加平台
联系人:王老师 13818765978

【课程特色】
非编码RNA(miRNA、lncRNA、circRNA等)是生物医药领域非常重要的一种调控分子。众所周知,非编码RNA虽然不参与蛋白编码直接行使功能,但它可以通过多样化的调控方式参与众多的通路和生物过程。目前,非编码RNA的研究是主流的创新研究思路,也是国家自然科学基金等鼓励申报的重要领域。因此,我们开办这次非编码RNA分析与设计培训班,通过集中和系统的学习,可以掌握非编码RNA分析与设计相关数据库、在线工具、本地软件的使用以及非编码RNA的创新思路设计。

【讲师背景】
宋伟,交大生物信息学博士,参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

【主要内容】详细内容见下文课表
1.非编码RNA的机制、调控模式
2.非编码RNA的创新文献解读
3.NCBI GEO数据库解读
4.miRNA-seq高通量测序解读
5.lncRNA-seq高通量测序解读
6.circRNA-seq高通量测序解读
7.ceRNA(竞争性内源RNA)的机制
8.lncRNA-mRNA共表达分析
9.三种非编码RNA分析创新思路

【学习目标】
掌握非编码RNA相关数据库/工具的使用、分析思路和实用操作知识点,设计贴合自身研究课题的方案。

【适合人群】
从事医学、动物、植物学等生物学方向的科研工作者。无需有工具操作和编程语言基础。

【使用软件】Cytoscape,GSE

【参会费用】
会务费:2800元
【优惠政策】
1.提前付款的,可以预先拿到学习资料
2.3人组团,每人优惠100元
3.4人组团,每人优惠200元
4.6人组团,可免一人会务费
提供正规发票和纸质盖章邀请函及培训证明

 
非编码RNA数据分析及研究思路班课表
时间安排 课程表 介绍
第一天上午 9:00~10:20 基础简介 生物信息介绍
非编码RNA的机制、调控模式(miRNA、lncRNA与circRNA)
非编码RNA的创新文献解读(含miRNA、lncRNA和circRNA)
10:20~10:40 茶歇(提供咖啡、水果、小零食)
10:40~12:00 数据库简介 NCBI GEO数据库解读
miRNA 注释数据库(注释及序列下载)
lncRNA注释数据库(注释及名称转换)
circRNA注释数据库
  12:00~13:30 午餐及午休
第一天下午 13:30~15:00 miRNA分析 miRNA-seq高通量测序解读
  1. 差异miRNA分析
  2. miRNA-mRNA数据库(验证和预测结果)
  3. miRNA与靶基因结合位点(MRE)分析
  4. VENN图分析
  5. 癌症的miRNA预后分析
15:00~15:20 茶歇(提供咖啡、水果、小零食)
15:20~17:00 lncRNA分析 lncRNA-seq高通量测序解读
  1. miRNA-lncRNA数据库
  2. lncRNA-target分析
  3. lncRNA参与的ceRNA分析
第二天上午 9:00~10:20 circRNA分析 circRNA-seq高通量测序解读
  1. miRNA-circRNA数据库
  2. circRNA参与ceRNA的分析
10:20~10:40 茶歇(提供咖啡、水果、小零食)
10:40~12:00 ceRNA分析 ceRNA(竞争性内源RNA)的机制
ceRNA关系对分析
ceRNA网络构建
  12:00~13:30 午餐及午休
第二天下午 13:30~15:00 功能富集分析 lncRNA-mRNA共表达分析
miRNA功能分析(GO和pathway富集)
lncRNA功能分析(GO和pathway富集)
circRNA功能分析(GO和pathway富集)
15:00~15:20 茶歇(提供咖啡、水果、小零食)
15:20~16:30 研究思路 miRNA高通量数据分析的创新思路
lncRNA高通量数据分析的常见思路
circRNA高通量数据分析的常见思路
备注:上课软件为Cytoscape,GSE。
会场不得录音录像。课后赠送一小时串联操作视频