产品介绍
 
FFPE是活检标本的一种保存和制备方式，有助于实验研究和诊断流程/药物开发。首先通过将组织样品固定在甲醛（也称为福尔马林）中来保存，以保护组织内的蛋白质和重要结构。接下来，将其嵌入石蜡块中，这样可以更容易地切割所需尺寸的切片，以便安装在显微镜载玻片上进行相关实验。
 
肿瘤结构变异 5% FFPE标准品是一种高度特征化，生物学相关的FFPE质量控制材料，涵盖多种基因变异，包含SNP和插入，缺失，拷贝数变异，基因融合等突变类型，用于评估从样本提取到定量的全流程各步骤，有助于修正和监测您的实验方案、操作规范及生物信息学流程等，并进行后续的一系列应用。
 
详细信息
 

突变类型	突变位点	突变频率	COSMIC编号	CDS突变	染色体编号	染色体位置
SNV High GC	AKT1 E17K	5%	COSM33765	c.49G＞A	14	104780214
SNV Low GC	PIK3CA E545K	5%	COSM763	c.1633G＞A	3	179218303
Long Insertion	EGFR_V769_D770insASV	5%	COSM12376	c.2307_2308insGCCAGCGTG	7	55181316-55181317
Long Deletion	EGFR_ΔE746-A750	5%	COSM6223	c.2235_2249del15	7	55174772-55174786
Fusion	CD74-ROS1 translocation	5%	COSF1200	NA	6,5	117700222,149782188
Fusion	EML4-ALK translocation	5%	COSF734	NA	2,2	42472827,29446394
CNV	MET amplification	3.5 copies	NA	NA	7	116672196-116798386
CNV	HER2 amplification	7.0 copies	NA	NA	17	39687914-39730426

 
 
QC标准
 

检测项目	检测方法	质量标准
等位基因突变频率	伯乐 QX200微滴式数字PCR	AF＝0，可接受AF≤0.1% ； AF＜1%，可接受误差范围＝±40%； 1%≤AF≤5%，可接受误差范围＝±30%； 5%＜AF≤20%，可接受误差范围＝±20% ； 20%＜AF，可接受误差范围＝±10%； 拷贝数变异＜5，可接受误差范围= ±10% ； 5≤拷贝数变异＜10，可接受误差范围＝±30%； 10≤拷贝数变异，可接受误差范围＝±20%
基因型	Sanger	检出突变
质量	琼脂糖凝胶电泳	电泳条带清晰明亮
定量	Qubit® dsDNA BR assay (DNA)	≥400 ng/片(Maxwell® 16 FFPE plus LEV DNA Purification Kit (Promega))
RNA表达（FFPE RNA）	End-Point RT-PCR	目标区域出现清新明亮的条带，而阴性对照组在目标区域不出现条带