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NanOnco Plus Panel v3.0
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品牌 Nanodigmbio
过期 长期有效
更新 2025-08-12 17:54
 
详细信息

NanOnco Plus Panel v3.0 靶向实体瘤研究中被广泛关注的 620 个基因 (含 HLA 基因) 的全部编码区、一系列与常见融合相关的内含子区域、经典的微卫星序列以及化疗相关多态位点,共涉及 637 个基因,覆盖基因组约 2.4 Mb 区域。支持包括碱基替换、插入/缺失、基因重排、基因扩增、微卫星不稳定在内的多种变异信息的富集。

产品表现

捕获表现

图1A
图1B
图1C



图 1. NanOnco Plus Panel v3.0 对不同 gDNA 文库的捕获表现。利用 NadPrep®快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® UDI Adapter (for Illumina®) 构建文库,测序模式为 Illumina Novaseq 6000,PE150,利用 BWA 比对到参考基因组 hg38,按照 reads 数计算。A. 捕获数据比对率和捕获效率;B. 靶区域覆盖度;C. 覆盖均一性和一致性。
注:样本 gDNA_1-4 分别为:人类男性基因组 DNA (Promega-male, G1471);肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良,GW-OGTM001);肿瘤 SNV 1-25% gDNA 标准品(菁良,GW-OGTM004);肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (菁良,GW-OGTM005)。

多种变异分析

图2

 

图2. NanOnco Plus Panel v3.0 捕获数据中变异频率与标准品标称频率的一致性展示。利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) 构建文库,测序模式为 Illumina Novaseq 6000,PE150, Vardict 进行变异分析。 

注:样本为 Onco Multiplex gDNA (LDTBIO,定制标准品),平均测序深度 3518x。

 

 

表 1. NanOnco Plus Panel v3.0 对其他变异类型检测。


202232-164135

利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® UDI Adapter (for Illumina®) 构建文库,测序模式为 Illumina Novaseq 6000,PE150, Vardict、Delly、CNVkit 分别进行变异分析。GW-OGTM001 的平均测序深度 966.71x,GW-OGTM005 的平均测序深度 1126.04x。
注:样本为肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良,GW-OGTM001) ,对照为肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (菁良,GW-OGTM005)。


仅限研究使用,不用于临床诊断。