OncoDEEP®试剂盒是一款用于肿瘤研究、分析的泛癌种基因检测科研用试剂盒（欧盟CE IVD标准）。本产品由成立于2012年的比利时生物技术公司OncoDNA自主研发，生产合作伙伴为Twist Bioscience, 以杂交捕获探针目标区域捕获技术为基础，适配于目前主流的高通量测序平台。该试剂盒涵盖了638个最相关的癌症DNA 基因与20个 RNA信息，基因组改变（SNV，插入，缺失，CNV和LOH）和复杂的遗传特征（HRD，MSI和TMB）。此外，OncoDEEP® 试剂盒还可以检测 DNA 水平的易位（ALK/RET/ROS1 基因）和异常剪接事件 （METex14）。试剂盒的设计根据生物学与临床相关性精准选择的突变位点，旨在提供全面的治疗，用药指导等信息。

产品特点
高性价比端到端的全面产品
合理的数据量，仍可产出优秀的数据结果。内部测试表明NextSeq 500 上平均测序深度 432X 的数据量中高质量数据达98.86%， 测序均一度达96.76%以上
 

	NextSeq  500 (n=1571)	NextSeq  2000 (n=441)	最低值
平均覆盖深度 （X）	432	540	350
平均覆盖均一度 (%)	96.76	96.68	85
平均reads数	42M	40M	32M

内部测序数据通过分析。携带致病或可能致病变异的10个最常见基因与先前发表的数据一致。 TP53是最常见的突变基因（18.64％），其次是KRAS（8.51％）和PIK3CA（4.80％）。此外，还确定了遗传特征（HRD，TMB和MSI）。 HRD在10.12％的病例中呈阳性，而TMB-H和MSI-H分别在8.06％和1.06％的病例中呈现。这些结果与先前报告的泛癌遗传特征的频率一致。

突变检测的灵敏度和准确度高

OncoDEEP® 试剂盒计算的参考标准品Horizon OncoSpan gDNA (ID: HD827) 结果展示
测序覆盖>350x, 均一度>85%，read数>32M

灵敏度	特异度	准确度
99.51%	100%	99.7%

可重复性可再现性

内部数据显示平均SD%为8.34%, 远在标准要求15%之下，可重复性高。 
并且我们在不同测序仪（NextSeq500）的分析结果相关性高达R²=99.35% ，可再现性高 样本量需求合理 
OncoDEEP®试剂盒也经过了不同DNA输入量（范围从6到100ng）的验证，并且即使在DNA含量较低的情况下也能够产生高质量的数据。内部使用了2012个样本分为三组进行平行实验，DNA量分为：100 ng，100-30 ng和30-6 ng。结果显示低至6ng也产出了一致性很强的高质量数据。 

产品详情请随时咨询cs@pegasusco.tech