核糖核酸酶R (Ribonuclease R，RNase R) 来源于大肠杆菌RNR超家族，是一种Mg2+依赖性的3'-5'核糖核酸外切酶，沿3'至5'方向将RNA逐步切割成二核苷酸和三核苷酸。RNase R几乎能够消化所有线性的RNA，但不易消化环状RNA、套索结构RNA和3'端突出少于7个核苷酸的短双链RNA分子。