CUT&Tag 是一种新的实验方法，用于研究组蛋白修饰和一些转录因子的基因组定位，从而揭示蛋白与DNA之间的相互作用或者鉴定感兴趣蛋白的DNA结合位点。

MNase-Seq和ATAC-Seq是把开放染色质作为研究对象，因此相当依赖于染色质的开放性。不同于这两个方法，CUT&Tag利用基于抗体的酶靶向特定的组蛋白修饰或蛋白，以揭示特定于这些感兴趣位点或蛋白的染色质结合信息。

CUT&Tag基于与ChIP-Seq相同的原理，但是对实验方法进行了一些相应的修改。在CUT&Tag中，新鲜的(未冷冻的)未固定的细胞与刀豆蛋白A磁珠结合，在细胞的原生状态下（native state）进行抗体孵育，不需要ChIP-Seq实验中固定染色质，超声处理和免疫沉淀的步骤。抗体结合后，染色质被消化，NGS建库通过使用预先接好adapter的proteinA - Tn5 (pA-Tn5)转座酶进行标记，一步完成。

与ChIP-Seq相比，CUT&Tag的起始材料更少，所需要的时间更短，产生结果更快，质量更高，而且能够以更低的测序深度进行稳健的分析，从而节省时间和金钱。

CUT&Tag-IT^® Assay Kit优势：

• 单次实验最少可使用5,000个细胞
• 提供完整的试剂和优化方案(excluding CUT&Tag-IT Core Assay Kit)
• 适用于组蛋白标记和一些转录因子
• 建库步骤简单成本降低
• 背景低因此可以降低测序深度
• 没有甲醛交联造成的假阳性结果