基于珠和柱的分离方法依赖于亲和结合系统的速度和易用性。配体，如链霉亲和素、抗体和凝集素，既可用于捕获特异性标记的靶点，也可用于分离自然表达配体结合伙伴的细胞和生物分子。植物凝集素的独特糖结合特性，如伴刀豆球蛋白A（Con A），使其可用于标记和分离血清和细胞裂解液中的聚糖呈递细胞和糖蛋白。凝集素还被用于细胞粘附研究，以影响淋巴细胞活化，并探索基于碳水化合物的疗法。伴刀豆球蛋白A磁珠也被用于切割和运行，这是一种染色质分析协议，与芯片相比具有几个关键优势。