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染色质可及性/开放性的试剂盒 Hyperactive ATA
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品牌 诺唯赞(Vazyme)货号TD711
过期 长期有效
更新 2025-08-12 19:07
 
详细信息
Hyperactive ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina

·  样本起始量更广:兼容100-100,000个细胞投入量
·  下机数据更优:TSS富集良好且IGV视图信噪比高

Hyperactive ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台定向开发的用于研究染色质可及性/开放性的试剂盒。ATAC-Seq全称Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,是利用转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术。其原理是利用转座酶Tn5可切割开放染色质区域的特性,对Tn5酶捕获到的开放染色质区域DNA序列进行测序。本试剂盒优化了实验反应体系和建库流程,与传统的技术相比,具有细胞投入量兼容范围广、实验周期短、信噪比高、应用范围广等优势,尤其适用于肿瘤疾病、生物发育、衰老等表观遗传学研究。

1. 样本起始量更广
参照Vazyme #TD711实验流程对不同细胞投入量(100-100,000个)的Hela细胞进行ATAC文库构建,不同细胞投入量下的扩增循环数如表1。结果表明:在不同细胞投入量下,TD711文库产出稳定,文库峰型呈现典型的Ladder状分布。Vazyme #TD711从试剂到流程均进行了优化,从而保证了优良的文库产出和峰型。
表1. 不同细胞投入量下的扩增循环数
细胞投入量(个) 100 500 5,000 10,000 50,000 100,000
扩增循环数(cycles) 21 20 16 15 14 12
 
图1. 不同细胞投入量下的文库产出  
 
细胞投入量(个) 100 500
2100峰图
细胞投入量(个) 5,000 10,000
2100峰图
细胞投入量(个) 50,000 100,000
2100峰图
图2. 不同细胞投入量下的文库峰型  
2. 下机数据更优
将参照Vazyme #TD711实验流程得到的文库进行测序,下机后各样本截取10 G数据量进行生信分析,结果表明:TSS富集图显示在基因的转录起始位点周围富集明显;IGV视图显示ATAC在关键位点上的富集情况与CUT&Tag和CUT&RUN一致,且在mRNA-seq中可以找到相应基因位点,实验结果真实可靠。
图3. 不同细胞投入量下的TSS视图  
注:CUT&Tag和CUT&RUN技术采用的靶点为H3K4me3。
图4. 不同细胞投入量下的IGV视图


BOX 1:1% Digitonin -30 ~ -15℃保存,室温(15 ~ 25℃)下可保存1周,其余组分-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。
BOX 2:2 ~ 8℃保存,根据不同目的地调整运输方式。