NanOnco Plus Panel v3.0

NanOnco Plus Panel v3.0 靶向实体瘤研究中被广泛关注的 620 个基因 (含 HLA 基因) 的全部编码区、一系列与常见融合相关的内含子区域、经典的微卫星序列以及化疗相关多态位点，共涉及 637 个基因，覆盖基因组约 2.4 Mb 区域。支持包括碱基替换、插入/缺失、基因重排、基因扩增、微卫星不稳定在内的多种变异信息的富集。

产品表现

捕获表现

图 1. NanOnco Plus Panel v3.0 对不同 gDNA 文库的捕获表现。利用 NadPrep®快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® UDI Adapter (for Illumina®) 构建文库，测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150，利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，按照 reads 数计算。A. 捕获数据比对率和捕获效率；B. 靶区域覆盖度；C. 覆盖均一性和一致性。
注：样本 gDNA_1-4 分别为：人类男性基因组 DNA (Promega-male, G1471)；肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM001)；肿瘤 SNV 1-25% gDNA 标准品(菁良，GW-OGTM004)；肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM005)。

多种变异分析

图2. NanOnco Plus Panel v3.0 捕获数据中变异频率与标准品标称频率的一致性展示。利用 NadPrep^® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep^® Universal Stubby Adapter (UDI) 构建文库，测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150， Vardict 进行变异分析。 

注：样本为 Onco Multiplex gDNA (LDTBIO，定制标准品)，平均测序深度 3518x。

表 1. NanOnco Plus Panel v3.0 对其他变异类型检测。

利用 NadPrep^® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep^® UDI Adapter (for Illumina^®) 构建文库，测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150， Vardict、Delly、CNVkit 分别进行变异分析。GW-OGTM001 的平均测序深度 966.71x，GW-OGTM005 的平均测序深度 1126.04x。
注：样本为肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM001) ，对照为肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM005)。

仅限研究使用，不用于临床诊断。