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产品介绍
NadPrep® DNA Library Preparation Kit v2 是基于 A-T 连接原理，针对 MGI & Illumina 高通量测序平台开发的双链 DNA 文库构建试剂盒。该试剂盒适用于 1‒500 ng DNA 的全基因组测序，同时兼容液相杂交靶向捕获测序。在 v1 版本的基础上，升级后的试剂盒提高了文库转化效率，同时对低质量的样本包容度更好，因此能在维持高保真度的同时，提升文库的丰富度.
产品特色
● 快速便捷
3 hr 内完成全基因组文库制备全流程
● 稳定高效
更高的文库产出
更高的文库转化率
低 GC 偏好性
更高的文库丰富度
● 灵活兼容
自由选择搭配多类型接头
兼容 1 ng-500 ng 起始投入量
兼容 gDNA、FFPE DNA、cfDNA 等样本类型
兼容液相杂交捕获
建库流程
产品表现
文库产出稳定高效
兼容宽泛的投入量
图 1. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 对不同起始量 gDNA 样本的建库产出。利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 分别搭配 NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 和 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行文库构建。A. 文库产出(MGI)；B. 文库产出 (Illumina)。
注：样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1521)。
兼容不同类型样本
图 2. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 对不同类型样本的建库产出。不同类型样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 分别搭配 A. NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 和 B. NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module (for MGI) 和 NadPrep® UMI Adapter Kit (with 10 nt Index) 进行文库构建，扩增循环数参考相应说明书。
注：样本分级标准 | gDNA：~ 15 kb 有明亮单一不拖尾条带；FFPE C：条带主要分布在 200-2500 bp，呈弥散状。
兼容不同类型接头
图 3. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 显著提升文库产出。不同投入量样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Kit/Module (for Illumina®/MGI) (NadPrep® v1) 和 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 (NadPrep® v2) 分别搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module [Universal Stubby (UDI)]、NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) [MDI]、NadPrep® UMI Adapter Kit (with 10 nt Index) [UMI] 和 NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module (for MGI) [BMI] 进行文库构建。
注：gDNA 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1471)。
低 GC 偏好性
图 4. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 对宏基因组样本的建库表现。A. ST菌，B. 大肠埃希菌和 C. 铜绿假单胞菌等不同 GC 含量的全基因组文库的 GC 偏好性。
更高的文库转化率
图 5. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 具有更高的文库转化率。10 ng 血浆 cfDNA 样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 分别搭配 NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module (for MGI) 和 NadPrep® UMI Adapter Kit (with 10 nt Index) 进行预文库构建，以 2 Kb Panel 搭配 μCaler 杂交捕获系统完成杂交捕获。测序模式分别为 DNBSEQ-T7，PE 150 和 Illumina Novaseq 6000，PE 150。每个样本随机选取 1.0 Gb 用于数据分析，以双链一致性序列 (Duplex Consensus Sequences, DCS211) 为标准进行过滤。
注：相对文库转化率：NadPrep® v2 及竞品建库试剂盒文库转化率与 NadPrep® DNA Library Preparation Kit/Module (for Illumina®/MGI) (NadPrep® v1) 文库转化率的比值 ( NadPrep® v1 文库转化率统一归一化为 1 )。
更高的文库丰富度
图 6. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 具有更高的文库丰富度。10 ng 血浆 cfDNA 样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 搭配 NadPrep® UMI Adapter Kit (with 10 nt Index) 进行预文库构建，以 2 Kb Panel 搭配 μCaler 杂交捕获系统完成杂交捕获。测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE 150。每个样本随机选取 1.0 Gb 用于数据分析，以双链一致性序列 (Duplex Consensus Sequences，DCS211) 、单链一致性序列 (SSCS) 为标准进行过滤。
兼容液相杂交捕获
图 7. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 构建文库的捕获表现。50 ng FFPE C 级 DNA 样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 构建预文库，500 ng/预文库投入，分别以 LungCancer Panel v1.0 (0.23 Mb) 和 NanOnco Plus Panel v3.0 (2.4 Mb) 搭配 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成杂交捕获，测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150。A. 捕获数据的比对率和中靶率；B. 靶区域覆盖度；C. Fold 80 base penalty； D. 靶区域去重后的平均深度。
标准品变异分析
图 8. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 构建文库的捕获数据中变异频率与标准品标称频率的一致性展示。利用 NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 构建文库，扩增 6 个循环，以 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 搭配 LungCancer Panel v1.0 (0.23 Mb) 完成杂交捕获，杂交 16 hr。
注：样本为肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM001)，起始投入量为 50 ng。
