NanOnco Plus Panel v2.0 靶向实体瘤研究中被广泛关注的 565 个基因(含 HLA 基因)的全部编码区,一系列与常见融合相关的内含子区域,以及经典的微卫星序列;共涉及 578 个基因,覆盖基因组约 2.6 Mb 区域;支持包括碱基替换、插入 / 缺失、基因重排、基因扩增、微卫星不稳定在内的多种变异信息的富集。
产品表现
图1. NanOnco Plus Panel v2.0 对不同 gDNA 文库的捕获表现。A. 捕获数据比对率均 > 99%,捕获效率 > 90%;B. 捕获数据均可达到 > 99% 的区域覆盖 > 0.2 x 平均测序深度;C. 不同gDNA样本的捕获覆盖均一性和一致性表现。
样本 gDNA_1-4 分别为:人类女性基因组 DNA(Promega,G1521)、肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品(菁良,GW-OGTM001)、肿瘤 SNV 1-25% gDNA 标准品(菁良,GW-OGTM004)、肿瘤野生型 gDNA 标准品(菁良,GW-OGTM005)。利用 NadPrep®️ 文库构建试剂盒(for MGI)建库,NanOnco Plus Panel v2.0 进行靶向富集,MGISEQ-2000 (PE150) 对捕获后文库进行测序,每样本取 1 M Read pairs 进行分析。
多种变异分析
图2. NanOnco Plus Panel v2.0 捕获数据中变异频率与标准品标称频率的一致性展示。
参考品为肿瘤 SNV 1-25% gDNA标准品(菁良,GW-OGTM004),利用NadPrep®️ 文库构建试剂盒(for MGI)建库,NanOnco Plus Panel v2.0 进行靶向富集,MGISEQ-2000 (PE150) 对捕获后文库进行测序。
产品订购信息
产品 | 货号 |
NanOnco Plus Panel v2.0, 16 rxn | 1001112E |
NanOnco Plus Panel v2.0, 96 rxn | 1001111E |
仅限研究使用,不用于临床诊断。