NadPrep® DNA 甲基化亚硫酸氢盐转化模块

NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module 是基于亚硫酸氢盐转化原理针对 DNA 样本开发的甲基化转化试剂。该转化 模块基于磁珠纯化的方案可在 2 hr 内将未甲基化的胞嘧啶高效转化为尿嘧啶，且利于自动化开展；同时可衔接纳昂达 NadPrep® 双链 甲基化文库构建方案和 NadPrep® 单链甲基化文库构建方案，支持在多种类型的起始样本中灵活选择。 

产品特色

• 兼容多类型样本且支持宽泛的投入量范围
• 胞嘧啶转化率高效稳定
• 卓越的 5mC 和 5hmC 检测灵敏度
• 操作便捷利于自动化开展

亚硫酸氢盐转化流程

*接头连接产物示意图以 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) 为例。

 

产品表现

文库产出及转化效率

图 1. 不同投入量样本的文库产出及转化效率。人类男性基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471) 利用 NadPrep^® Methyl Library Preparation Module 搭配 NadPrep^® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 和 NadPrep^® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module 构建文库，Illumina Novaseq 6000， PE 150 测序。A. 文库产出；B. 转化效率。

捕获表现

图 2. 不同甲基化水平样本的捕获表现。50 ng 不同甲基化水平的模拟样本利用 NadPrep^® Methyl Library Preparation Module 搭配 NadPrep^® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 经亚硫酸氢盐转化后构建文库，以甲基化 demo Panel (60 K) 进行杂交捕获，Illumina Novaseq 6000， PE 150 测序，On- target 按照 reads 数计算。A. 捕获数据比对率和中靶率；B. 靶区域覆盖度；C. Fold 80 base penalty；D. 去重后平均测序深度。注：样本为人甲基化阳性对照 100% Methylated DNA (zymo, D5014-2) 和阴性对照 0% Methylated DNA (zymo, D5014-1)，经不同比例混合以模拟不同甲基化水平 (0%， 50% 和 100%)。Vendor Q* 和 Vendor Z* 分别为：Vendor Q* 和 Vendor Z* 亚硫酸氢盐转化模块。 甲基化水平准确率 图 3. 不同甲基化水平样本的甲基化靶向测序表现。A. 理论甲基化水平与实际检测到的甲基化水平的比较；B. 靶区域 CpG 甲基化水平。