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空间转录组学分析试剂盒
Seeker Spatial Transcriptomics Kit将带有DNA条形码的单层10 μm微珠（Beads）平铺在玻片（Tile）上。通过在玻片上放置组织切片来捕获RNA。由于DNA条形码具有表示位置信息的固定序列，因此通过收集微珠并进行NGS分析，可以进行高分辨率的全转录组分析和空间分析。由于以含有polyA的全转录组为对象进行NGS分析，因此也支持人、鼠以外的真核生物。
产品亮点
√ 可以对冷冻组织开展全转录组空间分析本
√ 接近单细胞级别的分辨率，可解析所有基因
√ 利用带有DNA条形码的微珠（Beads）捕获mRNA
√ 不需要NGS以外的专用设备和探针
实验流程
将组织切片放置在Seeker玻片（Tile）上，与带有DNA条形码的微珠结合捕获mRNA，然后进行反转录。之后微珠从玻片上解离，进行第二链合成以及cDNA扩增。纯化的cDNA进行文库制备并测序。生成的FASTQ文件通过Seeker生物信息学软件处理，获得组织切片的完整全转录组的空间图谱。
产品规格：3 mm x 3 mm 和10 mm x 10 mm
| Seeker 3x3 kit | Seeker 10x10 kit | |
| 用途 |
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| 分辨率 |
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| 样本类型 |
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| index primer |
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| 分析软件 |
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| 玻片(tile)大小 |
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| 所需时间/手动操作时间 |
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| 推荐测序深度* |
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* 推荐测序深度取决于组织类型
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