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品牌	Clontech货号634354
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更新	2025-08-12 18:54

链特异性RNA建库试剂SMART-Seq® Total RN

带UMI的微量样本的链特异RNA-Seq分析
SMART-Seq^® Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR^™ Mammalian)

· 高灵敏度：可以人、大鼠或小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA或10-1000个细胞起始
· 添加UMI：准确识别真正变异和罕见突变，并校正来自PCR和测序错误以及重复序列
· 用途广泛：能分析质量较差的FFPE、LCM以及cfRNA来源的样本，生成高再现性的数据
· 操作简便：仅需要6.5小时即可完成文库构建，改良buffer配方，缩短文库纯化时间

注：SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR Mammalian) 是SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian的替代品，性能提升，如下所示：

i：提升ZapR技术去除rRNA cDNA效率，以更好地剔除不需要的reads信息
ii：试剂盒中不再包含index，但可以与Unique Dual Index (UDI) kits（24 Rxns，96 Rxns）灵活地搭配使用

■ 产品说明

SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR Mammalian) 设计用于从皮克级总RNA (250 pg-10 ng) 中高效制备Illumina测序文库。本试剂盒适用于高品质、部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。本试剂盒采用一体化操作流程，保留了链来源信息，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。本试剂盒设计在反转录步骤增加8 nt UMI（Unique molecular identifier)，以降低PCR偏倚，并为转录本定量提供额外的信息，特别是对于真正的变异和罕见的突变。
该试剂盒结合了SMART(Switching Mechanism at the 5' end of RNA Template)技术，包括对链特异性RNA-Seq的SMART方法进行改良，简化了文库制备流程并提升了测序性能。该方法可用于高质量或低质量的总RNA，不需要前处理rRNA，并且生成的是保留链来源信息的测序文库。整合了去除核糖体RNA来源的cDNA（以total RNA起始生成的cDNA中呈高丰度）流程，使得操作流程非常灵敏，生成的数据再现性高，rRNA比对率低。
全部操作流程，包括文库准备和纯化，只需要大约6.5 h。

不同样品起始量解决方案
·10-100 ng总RNA，推荐使用SMART-Seq Total RNA Mid Input
·100 ng-1 μg总RNA，推荐使用SMART-Seq Total RNA High Input (RiboGone^™ Mammalian)

■ 流程概要

■ 性能数据

☆ 小鼠脑总RNA-seq文库的转录组分析
选择250 pg的小鼠脑RNA样本起始，使用SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的模块处理（+）和未处理（-），然后通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。最后使用CogentAP 对3x10⁶ PE reads进行数据分析。

Panel A的柱状图和Panel C的表格数据展示了文库的reads分布，Panel B的柱状图和Panel C展示了文库基因检测数等数据

☆ 原代B细胞来源的Total RNA转录组分析
选择10 ng的人原代B细胞来源的Total RNA样本起始，使用SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的模块处理（+）和未处理（-），然后通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。最后使用CogentAP 对3x10⁶ PE reads进行数据分析。

Panel A的柱状图和Panel B的表格数据分别展示了用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit处理（+）和未处理（-）的文库基因检测数和转录本检测数

☆ 降解FFPE样本起始，可有效去除rRNA来源cDNA，获得可靠的结果
使用本试剂盒制备10 ng FFPE RNA文库 (RIN=3, DV200=77%)。使用CogentAP进行数据分析，使用3x10⁶ PE reads进行数据分析。

Panel A的柱状图和Panel B的表格数据，展示了文库的reads分布和基因组检测数

☆ 提升ZapR技术去除rRNA cDNA 效率
选择250 pg的人脑RNA样本起始，使用SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的模块处理（+）和未处理（-），然后通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。同时，使用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian对250 pg的人脑RNA样本制备文库。最后使用CogentAP 对3x10⁶ PE reads进行数据分析。

与SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian制备的文库相比，SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR Mammalian)制备的文库，rRNA相关reads百分比降低，外显子reads百分比增加。

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公司名	宝日医生物技术(北京)有限公司	经营模式	未填写
注册资本	未填写	公司注册时间	2004年
公司所在地		企业类型	企业单位 ()
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主营产品或服务	Takara，Clontech，Cellartis

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