
· 样本起始量更广:兼容100-100,000个细胞投入量
· 下机数据更优:TSS富集良好且IGV视图信噪比高

Hyperactive ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台定向开发的用于研究染色质可及性/开放性的试剂盒。ATAC-Seq全称Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,是利用转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术。其原理是利用转座酶Tn5可切割开放染色质区域的特性,对Tn5酶捕获到的开放染色质区域DNA序列进行测序。本试剂盒优化了实验反应体系和建库流程,与传统的技术相比,具有细胞投入量兼容范围广、实验周期短、信噪比高、应用范围广等优势,尤其适用于肿瘤疾病、生物发育、衰老等表观遗传学研究。

1. 样本起始量更广
参照Vazyme #TD711实验流程对不同细胞投入量(100-100,000个)的Hela细胞进行ATAC文库构建,不同细胞投入量下的扩增循环数如表1。结果表明:在不同细胞投入量下,TD711文库产出稳定,文库峰型呈现典型的Ladder状分布。Vazyme #TD711从试剂到流程均进行了优化,从而保证了优良的文库产出和峰型。
表1. 不同细胞投入量下的扩增循环数
细胞投入量(个) | 100 | 500 | 5,000 | 10,000 | 50,000 | 100,000 |
扩增循环数(cycles) | 21 | 20 | 16 | 15 | 14 | 12 |

图1. 不同细胞投入量下的文库产出
细胞投入量(个) | 100 | 500 |
2100峰图 | ![]() | ![]() |
细胞投入量(个) | 5,000 | 10,000 |
2100峰图 | ![]() | ![]() |
细胞投入量(个) | 50,000 | 100,000 |
2100峰图 | ![]() | ![]() |
2. 下机数据更优
将参照Vazyme #TD711实验流程得到的文库进行测序,下机后各样本截取10 G数据量进行生信分析,结果表明:TSS富集图显示在基因的转录起始位点周围富集明显;IGV视图显示ATAC在关键位点上的富集情况与CUT&Tag和CUT&RUN一致,且在mRNA-seq中可以找到相应基因位点,实验结果真实可靠。

图3. 不同细胞投入量下的TSS视图

图4. 不同细胞投入量下的IGV视图



BOX 1:1% Digitonin -30 ~ -15℃保存,室温(15 ~ 25℃)下可保存1周,其余组分-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。
BOX 2:2 ~ 8℃保存,根据不同目的地调整运输方式。