StarLighter PDX 模型小鼠浸润状态检测试剂盒
产品简介 PDX 模型,全称为人源肿瘤异种移植模型(Patient-Derived Tumor Xenograft,PDX),是来源于患者的肿瘤组织、原代细胞植入免疫缺陷鼠的体内形成的移植瘤模型,是癌症机制研究和药物测试的有用工具。但随着传代次数增加,肿瘤组织保真度可能会下降。小鼠细胞浸润不仅影响模型的稳定性,还可能导致实验数据偏差。 StarLighter PDX 模型小鼠细胞浸润状态检测试剂盒能准确检测人源、鼠源核酸浓度,检测小鼠细胞浸润状态。试剂盒提供了基于探针法 qPCR 核酸定量所必须的所有试剂,通过分别生成人源核酸检测标准曲线、鼠源核酸检测标准曲线,然后用绝对定量法通过 2 条标准曲线计算得到待测样本的人源核酸拷贝数浓度、鼠源核酸拷贝数浓度,从而有效评估小鼠细胞浸润情况,确保模型的保真度。
1. 使用前务必将试剂盒所有组分充分溶解并混匀。 2. Primer & Probe Mix、ROX 染料对光敏感,长时间暴露在直射光下会导致荧光信号强度下降。 3. 本试剂盒中提供的人/鼠混合模板 S1,对 S1 进行连续 10 倍梯度稀释,制备标准品,需要使用本试剂盒提供的 DNA 稀释液进行稀释。 4. 确保提取的核酸样本的纯度符合要求。 5. 根据 qPCR 仪器选择使用 ROX High 或 ROX Low。仪器与 ROX 参比染料对照表:
-25 ~ -15℃ 避光保存,< 0℃ 运输。
重要参数 本试剂盒提供了人/鼠混合模板(S1,0.25 × 108 copies/μL)(以下简称 S1)为 0. 25×108 copies/μL 的人和鼠标准模板,需要使用试剂盒提供的专用 DNA 稀释液组分将 S1 按比例稀释 10 倍,得到 S2,使用相同方法进行连续梯度稀释,得到 S2 ~ S6(0. 25×107 ~ 0. 25×103 copies/μL)。 稀释好的 S2 ~ S6 可在 2 ~ 8℃ 保存 8 小时以内,超过 8 小时请重新稀释。 样本质量 请使用合格的提取试剂盒提取 PDX 模型小鼠组织 DNA,由于不同试剂盒的提取纯度差异,可能造成qPCR 检测 Ct 值出现波动。样本洗脱液请使用超纯水或 Low TE 进行溶解。本试剂盒最高样本加入量不要超过 50 μg,最高样本加入体积不超过总体积的 1/2。 准确的移液操作 qPCR 是非常灵敏的技术,且本试剂盒需要对标准品进行稀释,因此结果的可靠性高度依赖于准确的移液操作。为确保检测结果准确,请注意以下操作: 1. 进行 S2 ~ S6 标准品稀释时,每个标准品的稀释后体积在 30 ~ 50 μL。 2. 每一次移取液体都要使用新的吸头。 3. 分配试剂后确保在吸头内没有液体残留。 污染和无模板对照 始终遵守良好的实验室规范,以避免工作区域的试剂、耗材和设备受到样本、标准品或扩增产物的污染。建议在每次检测中都设置无模板对照(No-Template Controls,NTC),用以检测在反应设置期间引入的污染。NTC 的 Cq/Ct 值应该至少比稀释的 S6 的 Cq/Ct 值多 3 个 Cq/Ct 值。 操作过程中,为减少污染发生,确保从低浓度到高浓度(即从 S6 到 S1)添加标准品到反应孔。 重复数据、数据可靠性、通量和每个样本成本 qPCR 是一种极其敏感的测量技术,易受多种来源的变化影响。标准品 S1 ~ S6,待测样本和阴性对照推荐均使用三个重复。 为了提高通量和降低每个样本的成本,重复次数可以减少到两次。在选择工作流程和通量要求的最佳策略时,请注意,数据的可靠性与重复数成正比。 1. 标准曲线扩增效率不在特定范围内(90 ~ 110%),可能原因: ① S6 与 S5 相比 < 3.1 个循环,且 NTC 小于 S6 之后的 3 个 Cq/Ct 值。 ② 扩增效率超过 100%,可能有污染。 ③ 基线设置可能会延迟 S1 的 Cq/Ct 值,影响扩增效率,需要手动调整基线。 ④ 不准确的移液操作。 1. R2 值 < 0.99,可能原因: ① 不准确的移液操作。 ② 仪器操作不当或试剂保存不当。 1. 标准品间隔不正确 (不在 3.1 ~ 3.6 个 循环),可能原因: ① DNA S5 和 S6 之间的 ΔCq/Ct < 3.1 可能有污染。 ② DNA S1 和 S2 之间的 ΔCq/Ct < 3.1 可能背景扣除有问题,需要手动调整基准。 ③ ΔCq/Ct > 3.6,扩增效率差。需要确保所有组分在使用前彻底混合,确认所有组分均以正确的体积添 加,并且使用正确的扩增程序。 ④ 试剂严重曝光会降低总荧光,并可能导致 Cq/Ct 值延迟,导致 ΔCq/ Ct 值> 3.6。 ⑤ 不准确的移液操作,标准品稀释梯度不准确。 1. 平行对照之间重复性差,可能原因: ① 不准确的移液操作。 ② 需要确保所有试剂在使用前彻底混合。 ③ 存在仪器相关问题,需要确保使用正确的参比染料。 1. 待测样本的 Ct 值不在标准曲线的动态范围内,可能原因: ① 该样本状态导致,如核酸含量非常低,在检测限以下。 ② 可能使用了过高或过低的样本投入量。 1. 标准品正常扩增,但待测样本没有,可能原因: ① 待测样本纯度不够,含有较多的抑制扩增成分。 ② 样本浓度过低。 |