产品特性
- t
- 1 ng ~ 1 μg样本起始量 t
- 配套UDI接头和纯化磁珠 t
- 文库覆盖均一,GC偏好性小 t
- 优化的实验流程,2.75 h完成文库制备
建库体系与流程
仅需要2.75 h,完成整个建库流程。
文库产出稳定高效
图1. NanoPrept™不同DNA起始量的文库产出。不同DNA起始量分别使用NanoPrep™与Vendor K在相同实验条件下进行文库构建,NanoPrep™与Vendor K表现相当。
建库覆盖均一
图2. NanoPrept™对较高GC含量基因组建库的偏好分析。分别对大肠杆菌(GC%=51%)和衣藻(GC%=62%)DNA以5 ng为起始量构建文库,100 bp区域的GC含量为横坐标,灰色柱状图表示基因组的GC含量分布,蓝色曲线代表在不同区域均一化的覆盖度。
捕获覆盖均一性好
图3. NanoPrep™文库外显子捕获覆盖度。NanoPrep™构建的文库(CV=0.58)相比Vendor K(CV=0.62)对外显子靶向覆盖均一性更佳。
外显子捕获表现优异
图4. NanoPrep™文库外显子捕获标新。NanoPrep™和Vendor K构建的文库均进行4-plex外显子混合捕获:(A)NanoPrep™中靶率高,重复率低;(B)取50 M Reads进行分析,NanoPrep™对外显子区域覆盖佳。
支持不同程度混合捕获
图5. NanoPrep™文库进行12-plex外显子混合捕获表现。(A)相同起始量的12个混杂文库外显子中靶数据产出均匀;(B)12个混杂文库平均中靶率92.17%,重复率7.89%;(C)每个文库取35 M Reads进行分析,超过98%的外显子区域达到0.2 x Mean 以上的覆盖度。
说明:若无注明,样本来源为人外周血液gDNA;测序模式为Illumina HISeq X,PE150;使用BWA工具对比到GRCh37/hg19参考基因组,取Flanked reads计算中靶率。外显子捕获探针来源是xGen Exome Research Panel。