GBclonart 无缝克隆 ( Seamless Cloning ) 是一种新的、快速、简洁的克隆方法。传统的PCR产物克隆方法主要有两种:一种是PCR引物设计时引入载体上的酶切位点,PCR产经双酶切后定向克隆到目的载体上;另一种是TA载体连接。这两种方法费时费力,过程繁冗。GBclonart无缝克隆和组装技术旨在克服上述缺陷,它可以在质粒的任何位点进行一个或多个目标DNA的片段的插入,而不需要任何限制性内切酶和连接酶。它可以为您解决克隆方面的技术困扰,提高您的工作效率,让您的工作变得轻松高效。
特点:
1.灵活的位点选择:可以在载体的任意位置进行基因克隆
2.快速简便:30分钟完成载体构建
3.精确:不需要增加任何额外的程序
4.克隆效率高:高达90%阳性克隆
适用范围:
1. 载体DNA片段克隆
2. 载体DNA转移
3. 高通量克隆
GBclonart 流程图:
GBclonart操作流程 :
A. 载体制备--线性化处理 | ||||||||||
1. 酶切法 选取合适的位点,单酶切或双酶切皆可,但是单酶切容易 导致载体自连,载体线性化不彻底容易导致假阳性的产生。为了降低自连背景,提高阳性率,建议采用双酶切,而且对酶切后的载体进行割胶纯化。 | ||||||||||
2. PCR法 选取合适的位点,设计正向和反向引物,建议采用高保真的DNA聚合酶扩增。为了避免模板质粒DNA对后续试验的影响,建议对PCR扩增后的线性化载体进行割胶纯化,去除环状模板质粒,提高阳性率。 | ||||||||||
B. 目的插入片段制备 设计引物进行目的片段的PCR扩增,引物设计要保证目的片段两端有至少15bp序列与线性化载体的两端一致便于重组反应的进行。PCR每条引物长度至少在35-40bp,包括5’端与载体同源的15bp以及目的片段特异性序列20-25bp。 (注意:如果是表达载体克隆构建,设计引物时,应注意检查读码框的正确性。引物的质量对克隆成功率有很大影响,请使用HPLC或PAGE纯化的引物。尽可能选用Pfu等高保真酶,同时建议对PCR产物进行割胶纯化。) | ||||||||||
C. 重组反应 | ||||||||||
1: 将目的DNA片段和线性化载体以适当摩尔比加到试管中进行反应,载体的用量为50-100ng。 (注意: 目的片段与载体的摩尔比在2:1-3:1之间最佳,否则会降低载体与目的片段的重组效率,反应时间30分钟,时间过长或过短均不利于重组反应。) 反应体系如下: | ||||||||||
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2. 混匀后在45 ℃水浴锅或PCR仪中放置30min,然后转移到冰上。 | ||||||||||
3. 立即进行感受态细胞转化实验,剩余反应液可保存在-20 ℃待用 | ||||||||||
D. 转化 1. 从-80℃取出一支含有100μl的感受态细胞的管子,冰上溶化。 将5μl反应液加入至100μl感受态细胞中,冰上继续放置5分钟。 2. 42℃水浴1分钟, 然后返回冰上放置2分钟。 3. 加入400μl不含抗生素的LB或SOC, 37℃震荡培养60分钟左右。 4. 将上述200μl感受态细胞均匀铺在含有抗生素的LB盘子上, 37℃温箱过夜。第二天,挑3--5个克隆进行检验。 |
引物设计:
如果线性化载体由酶切产生,根据酶点位置的不同设计引物,以下为三种常见引物设计方法: