架起组织学与基因组学的桥梁
带您认识Visium CytAssist
全新的Visium CytAssist是一款小巧的台式仪器,能够将转录组分析物从标准的载玻片转移到Visium玻片上,便于您从更多种类的样本中获得空间分析的见解。CytAssist仪器与H&E染色或免疫荧光(IF)染色的FFPE组织切片兼容,让预先以切片形式保存的组织也能用于Visium工作流程。您可以通过标准的组织学技术筛选组织切片,找到有生物学意义的切片,然后用CytAssist仪器将这些切片与Visium玻片的捕获区域精确对齐,从而最大限度发挥Visium实验的作用。
扩大使用范围,简化样本管理
有了Visium CytAssist,您可以在标准载玻片上制备组织切片,然后开展空间分析实验。就像典型的组织学流程一样,您随后可以对切片进行脱蜡、染色(H&E或IF)和成像。在您准备好空间分析时,可对切片进行解交联并与探针杂交,以捕获转录组分析物。在探针杂交后,Visium CytAssist可帮助将这些分析物从载玻片转移到Visium玻片的捕获区域。将两张标准载玻片和一张含两个捕获区域的Visium玻片放入仪器内,让载玻片上的组织切片与两个Visium捕获区域对齐。然后,您可以继续完成Visium流程的其余步骤。
Visium CytAssist可方便地转移FFPE样本中的转录组分析物。在Visium CytAssist流程中,切片、脱蜡以及染色和成像(H&E或IF)的步骤是在标准载玻片上进行的。在探针杂交后,将两张标准载玻片和一张含两个捕获区域的Visium玻片放入CytAssist仪器中,让标准载玻片上的组织切片与两个Visium捕获区域的顶部对齐。仪器捕获明场图像,以提供空间定位用于数据分析,然后将转录组分析物与Visium玻片杂交。其余步骤(从探针延伸开始)按照Visium FFPE标准流程在仪器外进行。
亮点
• 将转录组分析物从标准载玻片方便地转移到Visium玻片的捕获区域,简化样本处理
• 将样本兼容性扩展到贴有切片和预先染色的标准载玻片
• 通过标准的组织学技术预先筛选组织切片,选择出最有生物学意义的切片,从而最大限度地获Visium实验的见解
• 使用CytAssist专用玻片和试剂,每次运行可从最多两张FFPE组织切片中精确捕获分析物,而时间不到一小时
Visium CytAssist兼容性
• Visium FFPE 一张玻片两个反应,带有6.5 x 6.5 mm 或 11 x 11 mm捕获区域
• Visium FFPE空间基因表达