SAP4P(Sequence annotation pipeline for bacterium)是一款用于细菌DNA序列自动化注释的软件,可完成对细菌基因组序列、框架图序列和片段序列进行批量的基因预测、功能注释、COG分类、Gene Ontology分析、KEGG Pathway分析和图形化显示等一系列的分析,提供Reads和Contig统计分析、Contig基于参考序列排列和图形化显示。
主要功能: 1. 自动化的对文件中的每个大于500bp的序列进行编码框预测、注释和功能分类; 2. Contig和ORF统计; 3. COG功能分类; 4. KEGG Pathway分析; 5. tRNA, rRNA搜索; 6. Contig基于参照基因组的排列。 部分结果展示: